Архієпископ Афанасій (в миру Шкурупій Володимир Михайлович) народився 20 серпня 1954 року в с. Мала Шкурупіївка, Решетилівського району, Полтавської області в сільській родині. В 1971 році закінчив Решетилівську середню школу.
З 1972 по 1974 р. служив у Радянської Армії.
В 1975 році вступив на заочний відділ філологічного факультету Черкаського державного педагогічного інституту, який закінчив у 1981 році за спеціальністю «Вчитель української мови та літератури». З 1975 по 1978 рік працював редактором Решетилівського районного радіомовлення.
В 1987 році у видавництві «Радянський письменник» видав першу книжку оповідань та повістей «Жива роса», а в 1990 році другу книжку прози «Осіння горішина». В 1988 році прийнятий до Спілки письменників України.
В 1991 році заснував духовно-літературний альманах «Великдень» (вийшло у світ два числа часопису), а в 1992 році заснував всеукраїнську газету «Добродій», яка з 1995 року виходить у світ як щотижневе передплатне видання, а з 2005 року як релігійний православний двотижневик.
2004 році ніс послух в Богуславському та Феодосіївському чоловічих монастирях УПЦ КП. В 2005 році екстерном закінчив Житомирську духовну семінарію.
12 жовтня 2005 року в Житомирі архієпископом Житомирським і Овруцьким УПЦ КП Ізяславом (Каргою) пострижений у чернецтво, 13 жовтня рукоположений в сан ієродиякона, а 14 жовтня, в день Покрови Пресвятої Богородиці, рукоположений в сан ієромонаха.
З грудня 2005 року – насельник Свято-Троїцького чоловічого монастиря в м. Житомир.
З грудня 2006 року – настоятель Свято-Покровської церкви в селі Білки Житомирської єпархії.
З 7 квітня 2008 року на свято Благовіщення Пресвятої Богородиці піднесений до сану ігумена.
З 17 лютого 2009 року – призначений намісником Свято-Покровського чоловічого монастиря в с. Білки, Житомирської єпархії.
26 серпня 2009 р. рішенням Архієрейського Cобору УАПЦ визначений на єпископа Харківсько-Полтавської єпархії, а 15 листопада цього ж року в м. Київі в храмі Миколи Набережного хіротонізований на єпископа Харківсько-Полтавського.
В 2012 році закінчив Національний університет “Острозька академія” та здобув кваліфікацію магістра богослов’я (теологія).
3 червня 2015 року Божого, згідно рішення Архієрейського Собору, возведений в сан Архієпископа.